6月16日上午,應生命科學學院邀請,中國海洋大學生命科學學院生物工程系汪小龍副教授來我校講學,在生命科學學院412會議室做了題為“生物信息學和基因組學在生物制藥研究中的應用”的學術報告。生命科學學院部分教師、研究生和部分本科生聆聽了報告。報告會由生命科學學院馬云博士主持。
汪小龍博士的報告內容為生物信息學和基因組學在生物制藥研究中的應用。報告首先介紹了自創(chuàng)的一種新型核酸擴增技術-PEAR,隨后介紹了其課題組在基因組學和生物信息及計算生物學領域取得的進展。課題組通過兩種不同的系統(tǒng)發(fā)育分析方法、和泛基因組分析證明在東方國家中占多數(shù)的hpEastAsia的基因組大小顯著小于西方國家中占多數(shù)的hpEurope基因組。通過比較基因組學的方法,找到了hpEastAsia丟失的基因。還開發(fā)了一種新型核酸和蛋白質序列聯(lián)合比對分析方法和軟件-“密碼子-氨基酸聯(lián)合序列比對”,將蛋白質編碼DNA序列和其氨基酸序列組合,然后進行多序列比對。通過對HIV等病毒蛋白基因的實例分析,證實了用CAUSA軟件比對結果畫進化樹能夠克服分子系統(tǒng)和進化分析中常見的進化樹不準確和不一致問題,能夠更清楚地解釋進化事件。不僅提高了DNA和蛋白質序列比對的精確度,而且發(fā)現(xiàn)了幾種新的分子進化模式。
汪小龍,男,博士,副教授,中國海洋大學生命科學學院生物工程系。目前研究方向為生物技術、生物制藥、生物信息學、基因組學、計算生物學及其交叉學科。研究方向包括開發(fā)和應用新型核酸擴增技術,設計和開發(fā)新型基因轉移、基因表達調控及基因治療的方法和藥物(包括siRNA, miRNA和反義寡核苷酸等)。開發(fā)新型生物計算算法,編寫用戶友好的生物信息學軟件,用于DNA和蛋白質序列分析,數(shù)據(jù)挖掘,進行蛋白質空間結構模擬、分子系統(tǒng)發(fā)生、分子進化、分子生物學、基因組學和理論生物學研究。在Nucleic Acid Therapeutics,Journal of Bacteriology,Plos ONE, Biosystems, J. Molecular Evolution等雜志發(fā)表多篇論文。
(生命科學學院 程琳 供稿)